小型凍干機的自動控制包括二個部分，一是凍干機的各設備按凍干工藝要求在規定的時間自動走停，二是凍干箱板層溫度按凍干曲線要求自動跟蹤，整個凍干進程不需要人工操作，當然如果需要也可人工干預。 但有些的自動控制是不*的，僅能自動跟蹤凍干曲線，其余部分需人工操作。有些設備的自動控制僅能到凍干結束，凍干結束之后的箱內壓塞、冷凝器除霜以及蒸汽消毒不能自動進行，需要人工操作，特別是蒸汽消毒部分，因涉及到許多閥門控制，人工操作比較麻煩，應該選擇自動消毒程序的設備。有些自動控制是使用微機，操作、編程方便，顯示的語言是凍干語言，還帶有熒光屏，打印機和軟盤，能同時儲存幾十個凍程序，每個程序內容可顯示，整個程序內容可由打印機打出。而有的自動控制使用的是一種儀表，操作、編程均較麻煩，可儲存的凍干程序也較少。
1、制造商的選擇
有實力的廠家，并有多年的專業生產經驗和專業技術，支持非標定、解決方案。
2、冷阱溫度
冷阱是一種在冷凍干燥室和真空泵之間收集蒸汽的裝置，冷阱的溫度越低，冷阱的捕集能力越強，但冷阱的溫度越低，制冷要求越高，制冷量越大。機器成本和運營成本。
冷阱溫度主要為-50℃、-60℃和-80℃三個等級。從-35℃降至-50℃，冷阱的集水能力明顯提高，冷阱的溫度低于-50℃。80℃的稀土適合于大多數產品的冷凍干燥，如含有機溶劑的產品或某些特殊產品。
3、結冰量
在冷阱中可以捕獲的蒸汽量與實驗室中每天在操作樣品中升華的水或其它溶劑的量有關，冷凍容量為3kg、6kg和8kg，這適合于各種實驗要求。結果。
4、極限真空度
真空度反映了小型凍干機的泄漏情況和真空泵的泵送效率，實驗操作的真空度應在合理的范圍內。真空度過高，不利于傳熱，但干燥速度降低。
5、控制顯示系統
小型凍干機主要用于物料冷凍干燥、小批量生產和冷凍干燥工藝條件試驗，控制系統應實時顯示冷凍干燥工藝參數，如冷阱溫度、真空度、階段時間、溫度等。總加工時間；設定、修改和有效執行冷凍干燥工藝流程；有通訊接口，便于數據采集和存儲。
6、冷凍干燥方法及功能
根據具體的樣本，有不同的選擇實驗室凍干實驗過程B模式進行，即在冷凍干燥或冷凍干燥室掛瓶凍干。如果需要冷凍干燥室，則應購買冷凍干燥室，并選擇封蓋裝置。如果凍干掛瓶，多歧管應選擇，適用于圓底燒瓶、廣口瓶或安瓿瓶過濾的安全，但是要注意要選擇合適的適配器使用；如果用戶參與免費測試樣品腔ZE干燥，也有外部瓶冷凍干燥可以選擇與冷凍干燥腔。
一般來說，適用于食品、中草藥、粉狀物料等樣品的冷凍干燥，而必須選擇具有封蓋裝置的小型凍干機，建議采用吊瓶式，必須選擇安瓿B。用于冷凍干燥的OTTE適配器；如果要研究凍干過程曲線，則必須選擇控制器來支持共晶點測試裝置和軟件。
